Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb42P49222 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Epb42P49222 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Epb42P49222 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Epb42P49222 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms