Protein–RNA interactions for Protein: P48410

Abcd1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd1P48410 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Abcd1P48410 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcd1P48410 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms