Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SrprbP47758 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SrprbP47758 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SrprbP47758 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SrprbP47758 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrprbP47758 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrprbP47758 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SrprbP47758 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms