Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Tnfsf4P43488 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Tnfsf4P43488 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnfsf4P43488 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms