Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Nkx1-2P42580 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nkx1-2P42580 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nkx1-2P42580 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms