Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sept1P42209 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept1P42209 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Sept1P42209 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Sept1P42209 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sept1P42209 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept1P42209 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sept1P42209 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept1P42209 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Sept1P42209 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms