Protein–RNA interactions for Protein: P40338

Vhl, von Hippel-Lindau disease tumor suppressor, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VhlP40338 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
VhlP40338 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VhlP40338 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VhlP40338 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VhlP40338 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VhlP40338 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VhlP40338 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VhlP40338 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VhlP40338 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VhlP40338 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
VhlP40338 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VhlP40338 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VhlP40338 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VhlP40338 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VhlP40338 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VhlP40338 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VhlP40338 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VhlP40338 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VhlP40338 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VhlP40338 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VhlP40338 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
VhlP40338 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VhlP40338 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VhlP40338 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VhlP40338 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
VhlP40338 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VhlP40338 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VhlP40338 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
VhlP40338 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
VhlP40338 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VhlP40338 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VhlP40338 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VhlP40338 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VhlP40338 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VhlP40338 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms