Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
ThpoP40226 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
ThpoP40226 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ThpoP40226 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms