Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Lig1P37913 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lig1P37913 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig1P37913 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lig1P37913 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig1P37913 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lig1P37913 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lig1P37913 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms