Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab20P35295 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab20P35295 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab20P35295 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab20P35295 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rab20P35295 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms