Protein–RNA interactions for Protein: P35283

Rab12, Ras-related protein Rab-12, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab12P35283 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rab12P35283 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rab12P35283 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab12P35283 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab12P35283 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rab12P35283 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rab12P35283 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms