Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sftpa1P35242 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.2 ms