Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Apoc3P33622 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Apoc3P33622 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms