Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Pola1P33609 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola1P33609 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola1P33609 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Pola1P33609 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Pola1P33609 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola1P33609 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola1P33609 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pola1P33609 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pola1P33609 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms