Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cdh15P33146 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Cdh15P33146 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdh15P33146 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms