Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Hoxc5P32043 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hoxc5P32043 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms