Protein–RNA interactions for Protein: P31245

Hoxa2, Homeobox protein Hox-A2, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa2P31245 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxa2P31245 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Hoxa2P31245 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Hoxa2P31245 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms