Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RxraP28700 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RxraP28700 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RxraP28700 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
RxraP28700 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RxraP28700 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RxraP28700 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RxraP28700 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RxraP28700 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
RxraP28700 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RxraP28700 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
RxraP28700 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RxraP28700 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RxraP28700 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RxraP28700 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RxraP28700 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RxraP28700 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RxraP28700 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RxraP28700 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RxraP28700 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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