Protein–RNA interactions for Protein: P28663

Napb, Beta-soluble NSF attachment protein, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NapbP28663 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NapbP28663 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NapbP28663 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NapbP28663 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NapbP28663 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NapbP28663 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NapbP28663 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NapbP28663 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NapbP28663 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
NapbP28663 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NapbP28663 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NapbP28663 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NapbP28663 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NapbP28663 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NapbP28663 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NapbP28663 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NapbP28663 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NapbP28663 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NapbP28663 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NapbP28663 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NapbP28663 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NapbP28663 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NapbP28663 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NapbP28663 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NapbP28663 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NapbP28663 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
NapbP28663 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NapbP28663 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
NapbP28663 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NapbP28663 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NapbP28663 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NapbP28663 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NapbP28663 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NapbP28663 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NapbP28663 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NapbP28663 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NapbP28663 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NapbP28663 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NapbP28663 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NapbP28663 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NapbP28663 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NapbP28663 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NapbP28663 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NapbP28663 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NapbP28663 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NapbP28663 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NapbP28663 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NapbP28663 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NapbP28663 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NapbP28663 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NapbP28663 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NapbP28663 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NapbP28663 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NapbP28663 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NapbP28663 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NapbP28663 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NapbP28663 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NapbP28663 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NapbP28663 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NapbP28663 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NapbP28663 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms