Protein–RNA interactions for Protein: P28650

Adssl1, Adenylosuccinate synthetase isozyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Adssl1P28650 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Adssl1P28650 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Adssl1P28650 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 169.4 ms