Protein–RNA interactions for Protein: P28571

Slc6a9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a9P28571 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Slc6a9P28571 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc6a9P28571 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc6a9P28571 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms