Protein–RNA interactions for Protein: P28481

Col2a1, Collagen alpha-1(II) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col2a1P28481 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Col2a1P28481 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Col2a1P28481 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Col2a1P28481 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms