Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv4P28322 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Etv4P28322 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv4P28322 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv4P28322 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Etv4P28322 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Etv4P28322 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms