Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Xrcc5P27641 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.95■□□□□ 0.95
Xrcc5P27641 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Xrcc5P27641 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms