Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cd40lgP27548 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cd40lgP27548 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms