Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
U2af2P26369 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
U2af2P26369 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af2P26369 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af2P26369 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
U2af2P26369 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms