Protein–RNA interactions for Protein: P26011

Itgb7, Integrin beta-7, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb7P26011 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Itgb7P26011 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb7P26011 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb7P26011 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms