Protein–RNA interactions for Protein: P23804

Mdm2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdm2P23804 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Mdm2P23804 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Mdm2P23804 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms