Protein–RNA interactions for Protein: P21447

Abcb1a, Multidrug resistance protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1aP21447 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Abcb1aP21447 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Abcb1aP21447 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Abcb1aP21447 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcb1aP21447 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Abcb1aP21447 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms