Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Myo5bP21271 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Myo5bP21271 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Myo5bP21271 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms