Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Fcer1aP20489 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Fcer1aP20489 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms