Protein–RNA interactions for Protein: P20263

Pou5f1, POU domain, class 5, transcription factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou5f1P20263 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pou5f1P20263 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pou5f1P20263 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Pou5f1P20263 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms