Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VimP20152 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VimP20152 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VimP20152 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VimP20152 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
VimP20152 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VimP20152 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VimP20152 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
VimP20152 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
VimP20152 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VimP20152 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
VimP20152 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
VimP20152 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
VimP20152 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VimP20152 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VimP20152 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
VimP20152 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VimP20152 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VimP20152 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VimP20152 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VimP20152 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VimP20152 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
VimP20152 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VimP20152 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VimP20152 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VimP20152 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VimP20152 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VimP20152 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VimP20152 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VimP20152 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
VimP20152 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
VimP20152 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms