Protein–RNA interactions for Protein: P18340

Cxcl9, C-X-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl9P18340 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cxcl9P18340 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cxcl9P18340 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cxcl9P18340 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms