Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxb1P17919 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Hoxb1P17919 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 311.1 ms