Protein–RNA interactions for Protein: P17225

Ptbp1, Polypyrimidine tract-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptbp1P17225 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ptbp1P17225 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ptbp1P17225 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms