Protein–RNA interactions for Protein: P16330

Cnp, 2',3'-cyclic-nucleotide 3'-phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CnpP16330 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CnpP16330 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CnpP16330 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CnpP16330 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CnpP16330 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CnpP16330 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CnpP16330 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CnpP16330 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CnpP16330 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CnpP16330 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CnpP16330 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CnpP16330 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CnpP16330 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CnpP16330 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CnpP16330 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CnpP16330 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CnpP16330 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CnpP16330 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CnpP16330 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CnpP16330 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CnpP16330 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CnpP16330 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CnpP16330 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CnpP16330 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CnpP16330 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CnpP16330 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CnpP16330 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CnpP16330 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CnpP16330 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CnpP16330 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CnpP16330 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CnpP16330 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CnpP16330 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CnpP16330 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CnpP16330 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CnpP16330 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CnpP16330 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CnpP16330 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CnpP16330 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CnpP16330 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CnpP16330 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CnpP16330 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CnpP16330 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CnpP16330 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CnpP16330 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CnpP16330 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CnpP16330 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms