Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rag1P15919 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rag1P15919 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rag1P15919 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Rag1P15919 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms