Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Irf1P15314 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Irf1P15314 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Irf1P15314 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms