Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Vpreb2P13373 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms