Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Vpreb1P13372 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms