Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cd1d1P11609 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cd1d1P11609 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms