Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nid1P10493 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nid1P10493 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nid1P10493 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nid1P10493 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms