Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ifna9P09235 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ifna9P09235 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ifna9P09235 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms