Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxd3P09027 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Hoxd3P09027 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms