Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc8P09025 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc8P09025 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc8P09025 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc8P09025 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hoxc8P09025 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms