Protein–RNA interactions for Protein: P04940

Ig kappa chain V-VI region NQ2-17.4.1, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04940 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P04940 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P04940 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P04940 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P04940 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04940 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04940 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04940 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04940 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04940 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04940 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P04940 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04940 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04940 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04940 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04940 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04940 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04940 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P04940 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P04940 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04940 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04940 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04940 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04940 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04940 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P04940 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04940 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04940 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P04940 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P04940 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04940 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04940 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04940 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04940 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04940 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04940 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04940 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04940 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P04940 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
P04940 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms