Protein–RNA interactions for Protein: P04212

T-cell receptor beta chain V region LB2, mousemouse

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04212 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04212 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04212 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P04212 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P04212 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04212 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04212 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04212 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04212 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04212 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04212 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04212 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04212 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P04212 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P04212 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P04212 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P04212 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04212 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04212 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04212 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P04212 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04212 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04212 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04212 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04212 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P04212 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P04212 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04212 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04212 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04212 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04212 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P04212 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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