Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-K1P01901 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
H2-K1P01901 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2-K1P01901 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms