Protein–RNA interactions for Protein: P01822

Ig heavy chain V region MOPC 315, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01822 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
P01822 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
P01822 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01822 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
P01822 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
P01822 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
P01822 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01822 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01822 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01822 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01822 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01822 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
P01822 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
P01822 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
P01822 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
P01822 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
P01822 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01822 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01822 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms